Bệnh viện Tâm thần Trung ương 2 được thành lập từ năm 1915 với tên gọi ban đầu là trú xá của người Biên Hòa, và qua các thời kỳ với các tên như: Dưỡng trí viện Nam Kỳ (1937), Dưỡng trí đường Biên Hòa (1945), Dưỡng trí đường Trần Phú (1945), Dưỡng trí viện miền Nam Việt Nam tại Biên Hòa (1953), Dưỡng trí viện bác sĩ Nguyễn Văn Hoài (1955), Bệnh viện Tâm trí bác sĩ Nguyễn Văn Hoài (1971), Bệnh viện Tâm trí Biên Hòa (1975), Bệnh viện Tâm thần Biên Hòa (1980) và Bệnh viện Tâm thần Trung ương 2 (2003).
Hiện nay Bệnh viện được xây dựng trên diện tích gần 17 hecta với nhiều khoa phòng mới được xây dựng. Mô hình điều trị cửa mở “Open door” và nhiều phương pháp điều trị mới tiên tiến được áp dụng tại Bệnh viện như các liệu pháp tâm lý xã hội, các thuốc mới đã tạo nên cuộc cách mạng trong điều trị bệnh nhân tâm thần.
Được sự chỉ đạo và ủng hộ của Bộ Y tế, với sự nỗ lực của Bệnh viện hiện nay đội ngũ cán bộ của Bệnh viện gồm 800 người, trong đó có 01 tiến sỹ, 07 thạc sĩ, 03 bác sĩ chuyên khoa 2, 42 bác sĩ chuyên khoa 1 và đội ngũ điều dưỡng, nhân viên của Bệnh viện có trình độ cao, nhiệt tình nên trong năm 2010 đã điều trị cho trên 1300 bệnh nhân nội trú, hàng chục ngàn bệnh nhân ngoại trú. Bệnh viện đã thành lập thêm khoa khám và điều trị bệnh nhân có thẻ bảo hiểm ban đầu và chuyên khoa tâm thần tuyến cao nhất và đã được đông đảo bệnh nhân ủng hộ. Bệnh viện Tâm thần Trung ương 2 thực sự là cơ sở hỗ trợ và là tuyến cuối của 37 tỉnh thành phía Nam, kể cả thành phố Hồ Chí Minh.